先兆流产的原因有很多，最主要原因是遗传因素造成的胚胎异常。这种不正常发育的胎儿，如果足月产下，也会出现畸形或异常。除此之外，脐带供氧不足、羊水疾病等也是导致先兆流产的原因之一。如果孕妇孕期情绪不稳或者是营养不良也会造成导致流产。
其他原因如脐带供氧不足、羊水疾病、胎盘病毒感染以及某些妇科炎症等，也会引起流产。孕妇营养不良，也是流产的原因之一。有的孕妇早期有严重的妊娠恶心、剧吐，以致极度营养馈乏，对胚胎的发育有很大的影响，也容易发生流产。
常见的导致孕妇先兆流产的原因有以下几点：
1、胚胎因素：胚胎发育不正常或血型不合是早期流产最常见的原因。
2、母体因素：
(1)母体患有急慢性疾病，如有贫血、高血压、慢性肾炎、心脏病的准妈妈容易流产。
(2)母体受到病毒感染，或者因为高热，而引起子宫收缩导致流产。
(3)患有子宫畸形、盆腔肿瘤、宫腔内口松驰或有裂伤等生殖器官疾病。
3、免疫因素：母体妊娠后，由于母儿双方免疫不适应而导致母体排斥胎儿。
4、内分泌功能失调：主要是准妈妈体内黄体功能失调及甲状腺功能低下。
5、外界因素：
(1)准妈妈受到如：含汞、铅、镉等有害物质或有毒环境的影响。
(2)受到外界的物理因素，比如高温、噪音的干扰和影响，也可导致流产。