先兆性流产的原因可能是胚胎本身缺陷，环境影响，孕妇情绪不稳定，作息时间不规律等。
具体导致先兆流产的原因如下：
1、胚胎缺陷
父体或母体生殖细胞不健全是先兆性流产的主要原因，多见于染色体数目异常和结构异常。 不十分健全的生殖细胞虽然勉强结合起来成为胚胎，但终会早期死亡，没有办法正常长大，足月分娩。这种原因所引起的流产，其实可说是一件好事。因为不正常的胎儿，如果真的足月产下，也会有畸形或异常。
2、环境影响
环境因素影响生殖功能的事实，已被医务界认定，不仅引起女性的月经失调，内分泌系统功能异常，而且严重者可使生殖细胞的基因损坏，使妇女受孕后发生流产、死胎、早产、胎儿畸形或胎儿以及新生儿恶性肿瘤。
如果女性长期处于高辐射区域，接触过多的铅类用品，离污染物较近等，都会引起先兆性流产。
3、孕妇身体
如果母体患有全身性疾病，如严重贫血、心衰、高血压等疾病，生殖器疾病：单角子宫、双子宫、纵隔子宫以及宫颈口松弛等，其他原因如脐带供氧不足、羊水疾病、胎盘病毒感染等都会影响妊娠。
孕妇营养不良，也是流产的原因之一。有的孕妇早期有严重的妊娠恶心、剧吐，以致极度营养馈乏，对胚胎的发育有很大的影响，也容易发生流产。
4、其他方面
整个妊娠期间的性生活应持谨慎态度，不恰当的性生活尤其是在早孕早期易引起流产。在妊娠中期，性生活也应适度，避免压迫孕妇腹部的体位，以免引起流产。