乳头皲裂发生的原因主要是因为乳头皮肤相对于其他部分的皮肤薄，而且乳头皮肤富有韧性，受到伤害的话容易出现裂口、皲裂。在哺乳期发生的乳头皲裂主要有以下原因：
1、哺喂方式不正确。这种情况主要见于对哺乳知识比较不了解的新妈咪。部分妈咪在给宝宝喂奶时没有把乳头及大部分乳晕送入宝宝口中，宝宝长期、多次吮吸乳头顶部，在多次摩擦的情况下可造成乳头皲裂。此外，妈咪习惯让宝宝吮吸其中一侧乳房，也可导致单侧乳头皲裂。
2、乳汁分泌过多。一些妈咪乳汁比较充足，宝宝喝不完，可时常发生乳汁外溢继而导致乳头及周围皮肤被侵蚀，造成糜烂或湿疹，在没有及时处理或处理效果不理想的情况下可导致乳头皲裂。
3、宝宝口腔因素。由于宝宝的大脑没有完全发育，可存在运动功能失调的现象，部分宝宝或口腔有炎症，在喂奶的过程中，宝宝将乳头咬破也可造成乳头皲裂。还有些宝宝长牙齿后，妈咪在哺乳时没有让宝宝含住整个乳晕，也可发生宝宝咬住乳头，导致乳头皲裂。
4、乳头内陷或过小。乳头内陷是一种由先天发育障碍而引起的乳头异常症状，可分为三度。一度乳头内陷，乳头颈部存在，而且能轻易被挤出;二度乳头凹陷，乳头陷在乳晕之中，但可用手挤出乳头;三度乳头内陷，乳头完全埋在乳晕下方，无法使内陷乳头挤出。和乳头内陷一样，乳头过小也主要由先天因素导致。这两种情况容易导致宝宝吸吮困难，吸乳时用力过大发生乳头损伤，如果损伤处理不好，就可造成乳头皲裂。
5、皂类刺激。部分妈咪比较重视乳头的清洁，平时习惯用肥皂或乙醇干燥剂之类物品清洁乳头，如果清洁过度的话，也可造成乳头皮肤受刺激物、破损，继而发生乳头皲裂。
部分女性在非哺乳期发生乳头皲裂有可能是乳头过度清洁、性生活不当、乳头受病菌感染、蝇蛆噬咬发生莲蓬乳等因素导致。