食用藏红花出现副作用的不良反应主要表现为：腹部不适、腹痛、腹泻，甚或胃肠出血，腹部绞痛，妇女月经过多等，主要与红花对肠管及子宫有兴奋作用有关。
1、刺激神经。藏红花内含刺激神经的因子，如果长期服用会引起神经兴奋，打乱睡眠等作息习惯。
2、内分泌失调。藏红花虽然对于调节女性身体有益，但是服用过量，会影响女性内分泌情况，造成内分泌失调，产生一系列副作用。
3、经期紊乱。对于正常女性来说，月经一般是很有规律的。由于藏红花内富含女性所需的各种成分，极易造成月经周期过短和经期增长，从而严重影响女性身体健康。
藏红花中毒
大量使用藏红花会出现急性中毒的危险，导致呕吐、肠绞痛、胃肠出血、尿血等不良反应。中毒时，出现神志不清、震颤，严重者会出现惊厥、呼吸先兴奋后抑制。少数病人出现头晕、皮疹和一过性荨麻疹等，这与藏红花对神经系统的兴奋作用和过敏反应有关。引起红花中毒的主要原因有二：一是误用，二是用量过大。 一次摄取5克以上的量会有严重的副作用。出现中毒者，应该马上到医院就医。
藏红花食用禁忌
西红花主要兴奋子宫、肠管、血管及支气管平滑肌，对已孕的子宫尤甚，所以孕妇不宜使用，另外对于授乳中的妇女食用安全性上也存有疑虑。所以医用藏红花必须在医生的嘱咐下服用(一般医用在3克/次左右)，日常保健的话5克基本是一个月的量(每次7、8根藏红花可以泡3-4杯水 喝上一天)，为防止上火，喝3天停喝一天，怀孕、哺乳女性、正常女性月经期间禁用，有溃疡病及出血性疾病者应慎用。