1.中医治疗
采用有滋润肌肤、活络散瘀、驱风止痒功效的中药内服与外擦治疗该病疗效十分显著。一般都采用生地、麦冬、女贞子、旱莲草、山芋肉、白芍、西洋参、炒白术、天子片、玄参、红花、制首乌、枸杞、黑芝麻、灵仙、山药、荆芥、防风等中药的组方具有改善体内酶活性，使活性酶渗透至皮肤毛囊中从而平稳表皮及游离胆固醇的含量。对细胞膜的稳定起重要作用。能有效降低表皮中的胆固醇硫酸盐同时能有效调整胆固醇的代谢形成更多的胆固醇霜消除毛囊丘疹。
2、西医治疗
由于毛囊角化是与角质有关的疾病，所以一般的治疗都是以去角质药膏为首选，像是A酸、果酸、水杨酸及尿素等。口服维生素A或多吃富含维生素A的食物对本病的治疗有一定帮助；此外，外用皮肤角质软化或角质溶解剂，可以减轻症状，使皮肤表面变的比较光滑。如外用维甲酸、水杨酸药膏等，维甲酸的应用应该从低浓度开始，如从0.05%-0.1%，以避免对皮肤产生刺激，每天晚上用一次。注意药物需要长期坚持使用才能有效果。
3.冷光量子治疗
近几年随着冷光量子运用于皮肤美容，临床上治愈了大量“多毛”患者和雀斑、老年斑、斑痣患者。同时在治疗中发现，那些伴有毛囊角化病的患者患部的“小疙瘩”也神奇地消失了。毛囊角化病患者一般经过冷光量子两三次即可治愈。冷光量子不但可以治愈毛囊角化同时可将患部色素分解排出恢复正常肤色。如果毛囊角化患者已罹患多年病症，冷光量子无法治愈者可先以冷冻疗法治疗后再配以冷光量子，可有良好的治愈效果。
4、另外还需要注意的是，一般而言，毛囊角化除了外观不佳外，并无太大的不便。但最怕患者用手去抓，当患者抠抓时，会使毛孔周围的组织水肿。如此一来，毛孔开口变得更小更容易堵塞，就会产生粉刺、毛囊炎的现象。如果抓伤，也会形成疤痕及色素沉淀。届时要治疗或改善，就更加不容易，更加麻烦。所以建议患者应避免对皮肤造成损伤。