尖锐湿疣的潜伏期为3周至8个月，平均为3个月，以20-29岁年轻妇女多见。临床症状常不明显，多以外阴赘生物就诊，部分患者有外阴瘙痒、烧灼痛或性交后出血。病变以性交时容易受损伤的部位多见，如舟状窝附近、大小阴唇、肛门周围、阴道前庭、尿道口，也可累及阴道和宫颈。
50%-70%外阴尖锐湿疣伴有阴道、宫颈尖锐湿疣。尖锐湿疣初起为单个或多个淡红色小丘疹，顶端尖锐，呈乳头状突起，随病变进展，病灶逐渐增大增多，可呈菜花状、鸡冠状或团块状，表面凹凸不平，呈尖峰状，疣体常呈白色、粉红色或污灰色，柔软、质脆，表面可有破溃或感染。少数免疫能力下降患者疣体可过度增生成为巨大型尖锐湿疣。
发生尖锐湿疣后，由于HPV与机体免疫因素的相互作用，10%-30%患者的病变可自然消退，部分患者病变持续不变，部分患者病变进一步发展。宫颈病变多为亚临床HPV感染，临床见不到明显病变，需借助阴道镜及醋酸试验协助发现。