作为孕激素的黄体酮，以往医生的确曾常用来治疗先兆流产和习惯性流产，甚至大多患者都知道用它保胎。但是，临床实践是检验药品疗效的重要标准。从临床观察，并没有确切证据说明黄体酮对所有流产有效。相反，有些报告则认为，在妊娠早期应用黄体酮，还会增加致畸的危险。发生脊柱、肛门、心血管、气管、食道、肾脏及四肢的多系统畸形率增加8倍以上。
孕早期应用孕激素还会使胎儿心脏及大血管移位的可能性增多，特别是孕2-3月时，发生率为23.7%。据有关报道，用人工合成孕酮和炔诺酮，具有雄性化作用，可使胎儿男性化。其总发生率为18%，安宫黄体酮为1%。