对生理性柱状上皮异位合并感染者或糜烂样改变是因感染所致，可参考宫颈炎的治疗方法，进行抗感染治疗，主要为抗生素药物治疗。有性传播疾病高危因素的患者，尤其是不超过25岁的年轻女性，未获得病原体检测结果即可给予治疗，方案为阿奇霉素1g单次顿服;或多西环素100mg，每日2次，连服7日。对于获得病原体者，针对病原体选择抗生素。
1、单纯急性淋病奈瑟菌感染：主张大剂量、单次给药，常用药物有第三代头孢菌素，如头孢曲钠250mg，单次肌注，或头孢克肟400mg，单次口服;或大观霉素4g，单次肌内注射。
2、沙眼衣原体感染：治疗药物主要有四环素类，如多西环素100mg，每日2次，连服7日;红霉素类，主要有阿奇霉素1g单次顿服，或红霉素500mg，每日4次，连服7日;喹诺酮类，主要有氧氟沙星300mg，每日2次，连服7日;左氧氟沙星500mg，每日1次，连服7日。由于淋病奈瑟菌感染常伴有衣原体感染，因此，若为淋菌性宫颈炎，治疗时除选用抗淋病奈瑟菌药物外，同时应用抗衣原体感染药物。