由于自净作用的关系，耳垢会自行排出体外，因此没有必要每次都清洁。不过，新生宝宝有时会囤积湿润型的耳垢。并且因为分泌物很多，最好要勤于替宝宝做清洁。
(1)背面：洗澡时也可以做清洁。有时母奶或牛奶也会流过去，因此其实耳朵背面是很容易累积脏污的地方。有时会长湿疹或红肿，所以别忘记用浸泡过温水且拧干的纱布擦拭，来做清洁。
(2)耳洞：用棉花棒只在耳洞附近清洁。将宝宝的脸面向旁边，用单手压住头以免宝宝乱动，再开始进行清洁的动作。用婴儿棉花棒轻轻地清洁耳洞附近，小心不要把棉花棒伸得太里面。
(3)耳沟：使用纱布伸入耳沟里清洁。耳沟里也是容易囤积污垢之处。将浸过温水并拧干的纱布，缠在食指上来擦拭吧!在洗澡时若能清楚也可以。细微的部分可使用棉花棒来去除脏污。
温馨提示：清洁范围是耳朵外侧及耳洞口。为避免伤及内耳，只在耳洞附近及耳朵背面、耳朵外侧清洁即可。耳垢也只要清楚眼睛可以见到的部分就好。