甲亢的常见病因包括有弥漫性毒性甲状腺肿(Graves病)，慢性淋巴性甲状腺炎，妊娠呕吐暂时性甲亢。同时还有一些少见的病因包括毒性单发甲状腺腺瘤、毒性结节性甲状腺肿、亚急性甲状腺炎、碘致甲亢等。妊娠期的病理性甲亢相对少见，发病率也极低，即便是孕前就患有甲亢，也往往在怀孕后因免疫活性降低而自行缓解或减轻。不同病因所致甲亢有不同的生理改变。
1、弥漫性毒性甲状腺肿
弥漫性毒性甲状腺肿也称为Graves病，是一种自身免疫性疾病，占甲亢患者的60%～70%。生育年龄的妇女发病率高。有一部分妇女曾经患有弥漫性毒性甲状腺肿，经过治疗基本痊愈或已经完全痊愈后妊娠，这一类孕妇多有突眼等症状，需要通过药物控制病情。这类患者的体内存在有一种免疫球蛋白抗体，它可以引起胎儿和新生儿甲状腺增大和甲亢。
2、慢性淋巴细胞性甲状腺炎
慢性淋巴细胞性甲状腺炎又称为桥本氏甲状腺炎，是自身免疫性甲状腺炎患者体内有甲状腺自身抗体，包括甲状腺球蛋白抗体(TGAb)和甲状腺过氧化物酶抗体(TPO-Ab)。
3、毒性结节性甲状腺肿及毒性甲状腺腺瘤
单发或多发结节性甲状腺肿可以发展成甲状腺毒症而出现甲亢。缺碘所引起的甲状腺肿或腺瘤，可以进行外源性补充碘治疗而使病情缓解，如果由于单个的甲状腺腺瘤有功能亢进也可以考虑手术切除。孕妇合并毒性多发结节性甲状腺肿比较少见，孕妇如需手术治疗，尽量延缓到产后进行。
4、滋养细胞疾病
当出现葡萄胎和绒毛膜上皮癌时，这些病人的血清β-hCG水平很高，对甲状腺有刺激作用，血清TT4值比正常人升高1倍，临床上诊断可出现甲亢。当葡萄胎被刮宫清除后或者是绒毛膜上皮癌治愈后，血清β-hCG水平会相应降低，那么血清中的TT4下降甲亢症状也自然消失。