智力异常70%左右的孤独症儿童智力落后，但这些儿童可能在某些方面具有较强能力，20%智力在正常范围，约10%智力超常，多数患儿记忆力较好，尤其是在机械记忆方面。
自闭症和弱智常常连在一起。但并不是所有的自闭症儿童智商都是低下的，有个别自闭症儿童在某些领域如绘画、计算的表现极为出色。自闭症儿童虽然伴有全面性发育迟缓现象，但发育次序异常，且各方面发育不平衡。如：有的儿童大小便完全不能自理，却能有很强的计算、绘画能力;有的儿童完全没有或只有极少的语言，却在记忆力方面、识别颜色方面表现突出。
研究显示许多自闭症者的智商都在70以下，有研究指出，大约有69﹪的自闭症者的智商低于55。不过，在欧洲方面，有另外的研究则乐观指出只有44﹪的自闭症者智商在70以下，而智商在50以下的只有27﹪。
自闭症是一种广泛发育障碍性的疾病，患自闭症的孩子通常会在语言、智力、生活技能等方面有一定的发展障碍，也就是说他们不能像普通的孩子那样成长和生活。自闭症儿童由于社会适应性极差，人际交往的能力和主动性方面的能力远远低于弱智儿童，目前尚没有准确测量自闭症儿童智商的工具。
正如一位同时教过弱智儿童和自闭症儿童的培智学校老师所体会到的：智力低下(弱智)儿童愿意学，却学不会;自闭症儿童是能学会，却不愿意学。